近年来，随着各式质谱仪、流式细胞仪以及激光扫描共聚焦显微镜等设备的应用以及推广，使得荧光标记生物大分子药物检测的过程更加精简，且测定结果也更为准确。相较于同位素标记检测，将荧光标记法应用于生物大分子药物检测中，可以在很大程度上确保检测过程的安全性以及稳定性。
1. 将荧光标记应用于多糖类药物检测中。由于多糖的组成以及结构都较为复杂,对这类药物的分析检测也比较困难,对于这方面的研究还相对薄弱。
2. 将荧光标记应用于蛋白类药物检测中。蛋白类药物中含有大量的蛋白质，而蛋白质本身又是由多种氨基酸构成，其空间结构复杂，对其进行检测很容易受各种因素干扰，而运用荧光标记就可以简捷高效的对蛋白类药物进行定量分析。
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记盐酸博安霉素BAM
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记曲妥珠单抗
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记阿维菌素类药物
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记新霉素
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记紫杉醇-奥曲肽偶联物POC
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记沙拉沙星 Sarafloxacin
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记吲哚美辛
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记前列腺素E1  Prostaglandin E1  
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记前列地尔
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记前列腺素A2 Prostaglandin A2
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记前列腺素E2(PGE2) Prostaglandin E2
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记氢化可的松 Hydrocortisone
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记维生素EVE
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记维生素B6 Vitamin B6
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记维生素A Vitamin A
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记维他命D3 cholecalciferol
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记维他命D2 Ergocalciferol
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记维生素B3 Niacin
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记维生素B2 Riboflavin
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记石杉碱甲(Huperzine)
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记氟伐他汀 Fluvastatin
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记阿西美辛 Acemetacin
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记双醋瑞因 Diacerein
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记氨基蝶呤 Aminopterin
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记柔红霉素 Daunorubicin
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记苯丁酸氮芥 Chlorambucil
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记甲氨蝶呤 MTX
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记二氟沙星 Ciprofloxacin
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记扑酸Embonic Acid
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记醋氯芬酸Aceclofenac
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记利凡诺Ethacridine
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记氟尼辛Flunixin
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记氨丙啉Amprolium
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记卡托普利 Captopril
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记阿米舒必利 Amisulpride
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记缬沙坦Valsartan Valsartan
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记替米沙坦 Telmisartan
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记金刚烷胺 Adamantylamine
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记平阳霉素 Pingyangmycin
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记丝裂霉素 Mitomycin
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记二碘甲状腺原氨酸 T2
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记磺胺甲恶唑 SMZ
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记磺胺嘧啶 SD
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记磺胺多辛 SDM
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