目前多肽合成定制中，多肽标记及多肽修饰的内容非常多，常用的有N 端标记或修饰、N 端荧光素修饰、光敏剂修饰、N 端脂肪酸修饰、C 端标记或修饰、磷酸化标记、二硫键成环环化、赖氨酸修饰、高氨基酸修饰、PEG修饰、单标、双标、叠氮修饰、Mal修饰、N-Me修饰、偶联等。应用在多肽合成、多肽生物学、多肽抗体以及多肽合成试剂的研究中。目前常见有：非放射性核素标记（C13，H2，N15），荧光标记（FAM，FITC等），生物素标记，磷酸化修饰等。
瑞禧定制
多肽修饰纳米金/纳米银/量子点
多肽修饰上转换/金纳米簇发光颗粒
多肽修饰同位素N15/C13
多肽偶联小分子抑制
多肽偶联药物蛋白/糖载体
多肽偶联大环超分子瓜环/环糊精/冠醚
多肽偶联OVA/BSA/HAS/转铁蛋白/链霉亲和素等蛋白
多肽偶联半乳糖/甘露糖/透明质酸/壳聚糖/葡聚糖或糖苷/多糖分子
多肽偶联单糖/双糖/多糖/聚糖/寡糖/糖苷
多肽修饰介孔硅/MOF等多孔材料
多肽修饰普鲁士蓝等无机材料
多肽嫁接不同化学键如二硫键/腙键
多肽修饰石墨烯/碳纳米管/MOS2/普鲁士蓝/黑鳞等无机纳米材料
RGD和cRGD肽修饰标记荧光、纳米、聚合物
靶向肽/环肽/序列肽偶联磷脂脂质体
亲水性多肽偶联抗体
C端酰胺化多肽偶联定制
首尾成环，中间成环等环化反应多肽定制
多肽偶联抗体/蛋白载体
序列多肽定制
抗原多肽偶联蛋白定制
N端或C端修饰多肽定制
磷酸化的Ser、Tyr和Thr修饰的多肽
含有一对或多对二硫键修饰的多肽
含有特殊氨基酸修饰多肽
D型氨基酸，氨基酸衍生物，脂肪族羧酸修饰多肽